MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 1321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017778	ACA	2	6	8	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017778	ATAA	2	8	62	69	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017778	TAA	2	6	72	77	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017778	AAT	2	6	82	87	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017778	TTA	2	6	91	96	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017778	CT	3	6	187	192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017778	CA	3	6	236	241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017778	A	7	7	268	274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017778	ATT	2	6	281	286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017778	AT	3	6	307	312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017778	T	6	6	347	352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017778	CAT	2	6	361	366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017778	AT	3	6	365	370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017778	ATT	2	6	379	384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017778	T	6	6	387	392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017778	ATTTT	2	10	432	441	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017778	T	6	6	438	443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017778	A	7	7	452	458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017778	A	6	6	462	467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017778	AAAT	2	8	492	499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017778	TAA	3	9	518	526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017778	AC	3	6	555	560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017778	A	6	6	563	568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017778	CA	3	6	611	616	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017778	A	6	6	651	656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017778	CTTC	2	8	664	671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017778	ACAAT	2	10	694	703	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017778	CAT	2	6	712	717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017778	ATT	2	6	741	746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017778	TAT	2	6	765	770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017778	TCAAT	2	10	774	783	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017778	ATTT	2	8	789	796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017778	AATT	2	8	821	828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017778	T	8	8	860	867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017778	ATT	2	6	932	937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017778	A	6	6	942	947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017778	CTAT	2	8	948	955	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017778	ACT	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017778	ATC	2	6	988	993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017778	AAC	2	6	1014	1019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017778	A	6	6	1026	1031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017778	TA	3	6	1048	1053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017778	AT	3	6	1064	1069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017778	AATTAC	2	12	1104	1115	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017778	TAATA	2	10	1119	1128	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017778	TA	4	8	1158	1165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017778	TAT	2	6	1173	1178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017778	ATA	2	6	1189	1194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017778	TAC	2	6	1198	1203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017778	A	6	6	2362	2367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017778	TC	3	6	2408	2413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017778	A	7	7	2464	2470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017778	ATATTA	2	12	2522	2533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017778	AATT	2	8	3139	3146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017778	TAA	2	6	3153	3158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017778	ATT	2	6	3168	3173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017778	T	6	6	3207	3212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017778	A	6	6	3229	3234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017778	TAAAAA	2	12	3290	3301	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017778	AAT	2	6	3304	3309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017778	TCA	2	6	3375	3380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017778	AGC	2	6	3381	3386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017778	ACCAT	2	10	3407	3416	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_017778	AT	3	6	3436	3441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017778	T	6	6	3454	3459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017778	CTT	2	6	3470	3475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017778	AG	3	6	3488	3493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017778	AAG	2	6	3505	3510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017778	ATA	2	6	3538	3543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017778	CCT	2	6	4509	4514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_017778	ATT	2	6	4525	4530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017778	AATAA	2	10	4554	4563	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017778	TA	3	6	4575	4580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017778	AAAT	2	8	4601	4608	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017778	ATT	2	6	4616	4621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017778	A	6	6	4647	4652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017778	AAT	2	6	4661	4666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017778	ATA	3	9	4684	4692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017778	ATTAT	2	10	4697	4706	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017778	ATGTT	2	10	4719	4728	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017778	TA	3	6	4730	4735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017778	A	6	6	4735	4740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017778	T	6	6	4773	4778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017778	ATT	2	6	5592	5597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017778	ATT	2	6	5614	5619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017778	TAAT	2	8	5657	5664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017778	ATAA	2	8	5672	5679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017778	TAA	2	6	5681	5686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017778	AAATT	2	10	5708	5717	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017778	T	8	8	5729	5736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017778	A	6	6	5740	5745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017778	TA	3	6	5758	5763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017778	TA	3	6	5768	5773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017778	ATG	2	6	6676	6681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017778	GTT	2	6	6701	6706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017778	A	6	6	6714	6719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017778	TAA	2	6	6747	6752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017778	TA	3	6	6797	6802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017778	AAT	2	6	6809	6814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017778	ATA	2	6	6827	6832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017778	AT	3	6	6851	6856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017778	TGA	2	6	6858	6863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017778	AGT	2	6	6878	6883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017778	TA	3	6	7750	7755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017778	TA	3	6	7824	7829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017778	T	6	6	7838	7843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017778	ATT	3	9	7844	7852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017778	TAA	2	6	7875	7880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017778	TATT	2	8	7881	7888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017778	TAATTT	2	12	7892	7903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017778	TAT	2	6	7941	7946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017778	TAA	2	6	7954	7959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017778	CCA	2	6	7975	7980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017778	GGCT	2	8	8024	8031	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017778	T	7	7	8031	8037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017778	ATT	2	6	8065	8070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017778	AGT	2	6	8071	8076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017778	ATTT	2	8	8081	8088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017778	TTG	2	6	8114	8119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017778	TA	3	6	8137	8142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017778	TA	3	6	8167	8172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017778	TTA	2	6	8182	8187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017778	TAA	2	6	8194	8199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017778	AAT	2	6	8202	8207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017778	AGT	2	6	8217	8222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017778	AT	3	6	8251	8256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017778	TGT	2	6	8288	8293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017778	AAAT	2	8	8343	8350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017778	A	8	8	8368	8375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017778	GGT	2	6	8390	8395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017778	TTTTAT	2	12	8404	8415	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017778	AT	3	6	8421	8426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017778	ATT	2	6	8469	8474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017778	TAAA	2	8	8482	8489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017778	TAA	2	6	8515	8520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017778	TAA	2	6	8527	8532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017778	ATTTT	2	10	8537	8546	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017778	TTA	2	6	8576	8581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017778	TAT	2	6	8594	8599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017778	TAATT	2	10	8623	8632	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017778	TAA	2	6	8676	8681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017778	TTATA	2	10	8682	8691	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017778	TATT	2	8	8721	8728	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017778	AAT	2	6	8771	8776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017778	T	6	6	8792	8797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017778	A	6	6	8807	8812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017778	AT	3	6	8841	8846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017778	TAA	2	6	8849	8854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017778	A	6	6	8907	8912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017778	TAA	2	6	10021	10026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017778	TAA	2	6	10030	10035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017778	TAT	3	9	10036	10044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017778	GTT	2	6	10155	10160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017778	ATA	2	6	10209	10214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017778	TAA	2	6	10222	10227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017778	TAT	2	6	10246	10251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017778	ATTA	2	8	10257	10264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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